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Diagenode 的 iDeal ChIP-seq 套件for Transcription Factors 是一种经过高度验证的解决方案，适用于强大的转录因子和 ot她的非组蛋白 ChIP-seq 结果包含在下一代测序之前从头到尾完成 ChIP 所需的一切。这个完整的解决方案包含用于细胞裂解、染色质剪切、免疫沉淀和 DNA 纯化的所有缓冲液和试剂。此外，与竞争解决方案不同，该试剂盒包含阳性和阴性对照抗体（分别为 CTCF 和 IgG）以及阳性和阴性对照 PCR 引物对（分别为 H19 和肌红蛋白外显子 2），以方便您使用并保证获得最佳结果.
用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与细胞或组织兼容：
每个 IPCells4,000,000 个组织的量 30 mgiDeal ChIP-seq 试剂盒是市场上唯一的试剂盒经过主要测序系统验证。我们在 ChIP-seq 工具方面的专业知识可确保每次都能获得可重复且高效的结果。
TESTIMONIAL我们的一个问题是我们只能获得有限数量的细胞，这不足以规范的 ChIP-seq 协议。为了解决这个问题，我们使用了由用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒、用于 ChIPmentation 的 TAG 试剂盒和用于 ChIPmentation 的 24 SI 组成的 Diagenode ChIPmentation 解决方案。我们使用 IP-Star 自动化系统在 200 万个过表达 GATA6 的 iPS 细胞中对 GATA6 进行了 ChIPmentation。结果显示出清晰的信噪比并且具有高度可重复性。该解决方案也适用于体外分化的定形内胚层细胞（数据未显示）。
区域 1
![](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/chipmentation%20-gata6-region1.png\")
区域 2
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图 1. 使用用于 TF 的 iDeal ChIP-seq 试剂盒（货号 C01010055）对 Gata6 过表达的 hiPSC（人诱导多能干细胞）进行了 Gata6 染色质制备和免疫沉淀的 ChIPmentation 测序分析。来自 2,000,000 个细胞的染色质与 ei 结合用于免疫沉淀抗 GATA6 抗体。使用用于 ChIPmentation 的 TAG 试剂盒（货号 C01011030）和用于 ChIPmentation 的 24 SI（货号 C01011031）进行文库制备。
Takahiro Suzuki，博士，高级研究科学家，细胞功能转换RIKEN 综合医学中心技术团队，日本横滨引物）磁珠使 ChIP 变得简单、快速且可重复性更高与 Diagenode ChIP-seq 抗体结合可提供高产量以及出色的特异性和灵敏度纯化的 DNA 适用于任何下游应用易于遵循的协议细胞上的 ChIP-seq![\"CTCF](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-ctcf-diagenode.jpg\")
图 1.(A) 使用来自 HeLa 细胞的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq-grade CTCF 进行染色质免疫沉淀抗体。随后在 Illumina® HiSeq 上分析 IP 的 DNA。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。该图显示了 GAPDH 阳性对照基因周围区域的峰分布。
![\"CTCF](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-figure-b-total-diagendoe-peaks.png\")
图 1B。该实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到 Diagenode 的前 40% 之间的完美匹配peaks 和参考数据集。基于 NIH Encode 项目标准，ChIP-seq 结果被认为是可重现的赌注如果前 40% 的峰与比较数据集有至少 80% 的重叠率，我们就是原始数据集和复制数据集。
![\"ChIP-seq](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-TF-chip-seq-B.png\")
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图 2. 使用来自 HeLa 细胞的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq-grade HDAC1 (A)、LSD1 (B) 和 p53 抗体 (C) 进行染色质免疫沉淀。随后在 Illumina® Genome Analyzer 上分析经过 IP 处理的 DNA。文库制备、簇生成和测序g 根据制造商的说明进行。此图分别显示了 3 号染色体 (A)、12 号染色体 (B) 和 6 号染色体 (C) 区域的峰值分布。
ChIP-seq on tissue![\"ChIP-seq](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-figure-3a.jpg\")
图 3B。该实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到 Diagenode 的前 40% 之间的完美匹配peaks 和参考数据集。根据 NIH Encode 项目标准，如果前 40% 的 peaks 与比较数据集的重叠率至少为 80%，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间可重现。
已测试物种、细胞系、组织用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与多种细胞系、组织和物种兼容 - 下面显示了一些示例。可以使用其他物种/细胞系/组织
细胞系：
人：A549、A673、BT-549、CD4 T、HCC1806、HeLa、HepG2、HFF、HK-GFP-MR、ILC、 K562, KYSE-180, LapC4, M14, MCF7, MDA-MB-231, MDA-MB-436, RDES, SKNO1, VCaP, U2-OS, ZR-75-1
鼠标：ESC, NPC、BZ、GT1-7、腺泡细胞、HSPC、Th2 细胞, 角质形成细胞
牛：pbMEC、MAC-T
其他细胞系/物种：兼容，未测试
组织：
小鼠: 肾脏、心脏、大脑、虹膜、肝脏、来自 E10.5 胚胎的四肢
马：肝脏、大脑、心脏、肺、骨骼肌、椎板、卵巢
其他组织：兼容，未测试
酵母 ChIP
用于 TF 的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与酵母样本兼容。查看我们的应用说明，其中介绍了酵母 ChIP 的优化详细方案。
您是否在其他细胞系/组织/物种上使用了 iDeal ChIP-seq for Transcription Factors Kit？让我们知道！
感言我们对这种方法非常满意。它最终给出了良好的结果，并且需要的样本比我们可靠地执行传统 ChIP-seq 所需的样本少得多。在我们看来，与我们传统的 ChIP-seq 协议相比，ChIPmentation 试剂盒的主要优势是（首先是最重要的）：
样本要求更小，工作流程更简单，出错率更低，略更高的分辨率和信噪比。![](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/chipmentation-sequencing-p65.png\")
p65 的 ChIPmentation 测序配置文件。使用用于 TF 的 iDeal ChIP-seq 试剂盒（目录号 C01010055）对刺激的 NIH3T3 细胞进行染色质制备和免疫沉淀。来自 4,000,000 个细胞的染色质与抗 p65 抗体或 IgG 结合用于免疫沉淀。使用用于 ChIPmentation 的 TAG 试剂盒（目录号 C01011030）和用于 ChIPmentation 的 24 SI（目录号 C01011031）进行文库制备。
法国尼斯尼斯索菲亚大学研究员过去三年我一直在使用 Diagenode 产品进行 ChIP-seq，我对 Bioruptor、试剂盒和抗体非常满意.我使用了用于组蛋白的 iDeal ChIP-seq 套件和用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 套件，结果非常成功且可重现。有一次我尝试用自制的协议对组蛋白进行 ChIPol，与 Diagenode 套件相比，它的效果要差得多。在其他情况下，我尝试了一种非成岩节点抗体作为转录因子，但我也得到了很差的结果，但是使用成岩节点抗体，我总是得到非常好的结果。我强烈推荐使用 Diagenode 产品。
Dr. Francisca Martinez Real - 发展与疾病研究小组 - 德国柏林马克斯普朗克分子遗传学研究所我从事 ChIP 已有很长时间，并尝试了来自不同国家的许多试剂盒Active Motif、Millipore/Upstate 和自制试剂等来源。在一位同事推荐来自 Diagenode 的用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒之前，重复性和结合功效从来都不是最佳的。我已经使用该套件完成了一百多个 ChIP 和 ChIP-seq 样本。结果非常一致，结合效率高于所有其他方法。我肯定会推荐这个 ChIP试剂盒从 Diagenode 提供给所有尝试做 ChIP 或 ChIP-seq 的人。
约翰霍普金斯大学医学院研究员市场上有很多 ChIP 相关产品，但我感到很幸运，自从我开始我的 CHIP-seq 项目以来，我一直在使用来自 Diagenode 的那些。我使用了他们的 iDeal CHIP-seq Kit for Transcription Factors 和 MicroPlex Library Prep Kit v2。它们都很棒，而且非常可重现。有了写得很好的协议，你就可以在家了。我要特别感谢技术支持，他们非常耐心、知识渊博并且非常乐于助人。我肯定会推荐我的同事使用 Diagenode 的 CHIP 产品。
伦敦帝国理工学院外科与癌症系医学院雷凯宇博士新的 Bioruptor® Pico 机器减少了花费的时间大量超声处理染色质。一些协议需要相当苛刻的固定条件，这意味着在 o 上将 DNA 片段化ld机器进行了很多轮和几次。使用新的 Bioruptor®Pico 机器，这些超声处理仅需进行 10 个循环中的一轮，从而大大减少了碎裂时间。超声处理后，我使用了新的 IDeal ChIP-seq 套件。这是一个很好的直接试剂盒，如果随后使用适当的经过芯片验证的抗体，会产生惊人的芯片序列结果，这些结果一次又一次地与几种不同的转录因子一起工作。我会推荐这两种试剂盒以获得良好、一致的染色质工作。
Dr. Karen Dawson，英国曼彻斯特大学曼彻斯特癌症研究所 RNA 生物学小组对于 TF，推荐用于优化染色质剪切，这是 ChIP 的关键步骤。ChIP Cross-link Gold 在工作时应与甲醛结合使用具有更高阶和/或动态相互作用，以实现高效的蛋白质-蛋白质固定。
对于免疫沉淀样品的文库制备，我们建议使用 MicroPlex 文库制备试剂盒 - 已针对皮克输入的文库制备进行验证。
ChIP-seq 级抗体提供高产量以及出色的特异性和灵敏度。
查看专为特定基因组区域提供高特异性而设计的可用引物对列表。
另外，对于我们的 IP-Star Automation 自动化 ChIP 用户，请查看该试剂盒的自动化版本。
DocumentsChromatin Brochure BROCHURE 无论您是染色质免疫沉淀领域的老手还是新手，Diagenode 都有... 下载iDeal ChIP-seq 试剂盒用于转录因子 - 手册 MANUALDiagenode 的 iDeal ChIP-seq Kit for Transcription Factors 是一个高度专业化的解决方案...torは、强力の転写因子ChIP-seqの结果を得るための高度ニ特化されたソリューシェンド... 下载通过ChIP优化引导RNA的选择以保持CRISPR -target APPLICATION NOTE目标识别和目标特异性的机制的 Cas9 蛋白仍未合成... 下载 TFs 协议的自动芯片化 下载应用说明 - ChIP on yeast 应用说明应用说明：\"使用 iDeal® 染色质免疫沉淀 (ChIP) 试剂盒进行 ide... 下载安全表iDeal ChIP-seq转录因子试剂盒 SDS GB en DownloadiDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒 SDS US en 下载iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒 SDS DE de 下载iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒 SDS JP ja DownloadiDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒 SDS BE nl 下载iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒SDS BE fr 下载iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒SDS FR 下载iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒SDS ES es DownloadPublications![](\"https://cdn0.iconfinder.com/data/icons/mtt-web-icons/139/article-128.png\"){kind=icon}
如何在你的作品中正确引用这个产品Diagenode强烈推荐使用这个：iDeal用于转录因子的 ChIP-seq 试剂盒 (Diagenode Cat# C01010055)。单击此处复制到剪贴板。
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AKT 的激活诱导 EZH2 介导的 β-连环蛋白三甲基化结直肠癌。 GhobashiA. H. et al. 结直肠癌 (CRC) 的发展部分是通过不同信号通路的失调，包括 WNT/β-连环蛋白和 PI3K/AKT 通路的激活。 zeste 同系物增强子 2 (EZH2) 是一种赖氨酸甲基转移酶，参与调节干细胞发育和分化，并且超过...
低亲和力 CTCF 结合驱动转录调节，而高亲和力结合包含结构功能 Marina-萨拉特E。等。 CTCF 是一种 DNA 结合蛋白，在染色质结构组织中起着关键作用化和转录调控；然而，关于不同 CTCF 结合位点 (CBS) 的功能决定因素知之甚少。使用条件小鼠模型，我们已经确定了一组在 CTCF 去...时丢失的 CBS。
ZEB1 控制着黑色素瘤细胞状态转换 TangY 所必需的谱系特异性转录程序。等人。细胞可塑性维持黑色素瘤的肿瘤内异质性和治疗耐药性。为了设计新的治疗策略，需要破译控制增殖/分化和侵入/干样状态之间可逆表型转变的转录机制。 EMT 诱导 ...
人诱导多能干细胞的定形内胚层和肝细胞分化数据集。田中et al.Hepatocytes 是肝脏中主要的实质细胞类型，在肝功能中起着至关重要的作用。肝细胞样细胞可在体外由诱导多能干细胞分化s (iPSCs) 通过定形内胚层 (DE) 样细胞和成肝细胞样细胞。在这里，我们探讨了体外分化...
盐皮质激素受体通过糖皮质激素受体调节基因组结合的时间和位置，以响应合成糖皮质激素角质形成细胞。 Carceller-ZazoE。等人。糖皮质激素 (GCs) 具有强大的抗增殖和抗炎特性，解释了它们对皮肤病的治疗功效。 GC 通过结合 GC 受体 (GR) 和盐皮质激素受体 (MR) 发挥作用，它们在经典和非经典靶标（包括角质形成细胞）中共同表达。使用敲...
通过表观遗传重编程 AntunesA 在体外产生猫限制性弓形虫性前阶段。由于围绕使用猫作为模式生物的伦理问题，V.et al.Sexual reproduction of 仅限于猫科动物的小肠，记录很少。染色质修饰剂决定寄生虫的发育命运te 在其多阶段生命周期中，但它们靶向阶段特异性顺式...
小鼠口腔鳞状细胞癌中 p63 驱动的调控网络的系统和综合分析。格拉萨A. R. et al.Oral squamous cell carcinoma (OSCC) 是最常见的口腔恶性肿瘤，与烟草暴露、饮酒和人乳头瘤病毒感染有关。尽管治疗取得了进展，但缺乏对疾病病因的分子理解以及诊断延迟继续对研究产生负面影响。
芳基烃受体细胞本质上促进常驻记忆 CD8 T 细胞分化和功能。院长J。 W. et al.The Aryl hydrocarbon receptor (Ahr) regulates the differentiation and function of CD4 Tcells；然而，它在 CD8 T 细胞中的细胞内在作用仍然难以捉摸。在此我们表明 Ahr 充当驻留记忆 CD8 T 细胞 (T) 分化和功能的启动子。小鼠 CD 中 Ahr 基因消融...
Fetal Expo 的影响确保内分泌干扰化学混合物对成年大鼠睾丸中 FOXA3 基因和蛋白质表达的影响。沃克C. et al.Perinatal 暴露于内分泌干扰化学物质 (EDC) 已被证明会影响男性生殖功能。然而，以与人类相关的剂量接触 EDC 混合物对男性生殖的影响尚未得到充分表征。在之前的研究中，我们发现在子宫内暴露于...
E3 连接酶的鉴定，该酶在转录应激时靶向 RNA 聚合酶 I 的催化亚基。 PittsStephanie et al.RNA 聚合酶 I (Pol I) 合成核糖体 RNA (rRNA)，这是核糖体生物发生的第一步，也是限速步骤。控制聚合酶复合物稳定性的因素尚不清楚。先前对 Pol I 抑制剂 BMH-21 进行表征的研究揭示了一种转录应激依赖性途径，用于降解...
组蛋白去乙酰化酶 1 和 2 肾单位祖细胞的靶基因调控网络，以控制 n发生。 LiuHongbing 等人。我们的研究证明了组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 在肾发生调节中的关键作用。为了更好地了解 HDAC1/2 在早期肾发生中调控的关键通路，我们对分离的肾单位祖细胞 (NPC) 进行了 Hdac1/2 的染色质免疫沉淀测序 (ChIP-Seq)。
鉴定转录因子 DDIT3/CHOP 的基因组结合位点和直接靶基因。奥斯曼A。 et al.DDIT3 是一种受到严格调控的碱性亮氨酸拉链 (bZIP) 转录因子和细胞应激反应中的关键调节因子。它参与多种病理状态，并可能引起细胞周期阻滞和细胞凋亡。它还与某些特殊细胞类型的分化有关，并作为致癌基因...
雄激素诱导的 MIG6 调节视网膜母细胞瘤蛋白和 AKT 的磷酸化，以抵消前列腺癌细胞中的非基因组 ARS 信号传导。舒曼T。等双极雄激素疗法（BAT）包括治疗具有超生理雄激素水平 (SAL) 的前列腺癌 (PCa) 患者。有趣的是，SAL 在 PCa 细胞系中以及在离体患者的肿瘤样本中诱导细胞衰老。 SAL 介导的细胞衰老被证明是雄激素受体 (A...
ATM 和 ROCK 的共同抑制通过激活 FOXM1 和 E2F1 协同改善复制衰老中的细胞增殖。YangEun Jae 等人。多方面的衰老细胞周期停滞的性质需要靶向多种因素来停滞或促进细胞周期。我们报告说，KU-60019 和 Y-27632 分别共同抑制 ATM 和 ROCK，协同增加正在复制的人二倍体成纤维细胞的增殖...
多囊卵巢综合征患者的外周昼夜节律基因异常改变了雄激素合成的外周转化。JohnsonB.S. 等人研究问题：昼夜节律基因在外周血单核细胞中是否表现出改变多囊卵巢综合征 (PCOS) 患者的皮细胞 (PBMC)，它们在雄激素过多中是否具有潜在作用？总结性回答：我们的研究结果表明，受损的生物钟可能会妨碍外周...
GATA6 预计会在人类肝细胞分化的体外模型中调节 DNA 甲基化。铃木T。 et al.Hepatocytes 是人类肝脏中的主要细胞类型，具有代谢、解毒和产生分泌蛋白的功能。尽管参与肝细胞分化的基因调控和主转录因子已被广泛研究，但人们对表观基因组如何...知之甚少。
人类早期 FOSL1、FOSL2 和 BATF 介导的转录调控的系统比较Th17分化。谢蒂A。等人。Th17 细胞对于抵御细胞外病原体至关重要，但它们的异常活动会导致自身免疫。决定 Th17 细胞差异的分子机制已经使用小鼠模型广泛研究了 ntiation。然而，物种特异性差异强调需要验证这些发现......
一个涉及 PPARγ、酰基辅酶 A 结合蛋白和 GABA 受体的致肥胖前馈回路。 AnagnostopoulosGerasimos 等人。酰基辅酶 A 结合蛋白 (ACBP)，也称为地西泮结合抑制剂 (DBI)，是食欲和脂肪生成的有效刺激物。生物信息学分析结合系统筛选表明，过氧化物酶体增殖物激活受体 γ (PPARγ) 是最能解释...
新生少突胶质细胞分化 MerourE 需要通过 Tensin3 瞬时调节粘着斑。等。少突胶质细胞从少突胶质细胞前体细胞 (OPCs) 分化为复杂且广泛的髓鞘形成少突胶质细胞 (OLs) 是一个多步骤过程，涉及大规模的形态学变化，并对细胞骨架产生显着应变。而关键染色质a差异转录调节因子...
人巨细胞病毒 (HCMV) UL84 独立株中立即早期 2 (IE2) 和 UL84 蛋白的特征 Salome Manska 和 Cyprian C Rossetto 人巨细胞病毒 (HCMV) 立即-early 2 (IE2) 蛋白是病毒基因表达的主要反式激活因子，是裂解复制所必需的。除了转录激活外，已知 IE2 还介导启动子的转录抑制，包括主要的立即早期 (MIE) 启动子和...
ThPOK 自动调节环在维持成熟 CD4 T 中的重要作用细胞特性和功能。 Basu Jayati 等人。转录因子 ThPOK（由 Zbtb7b 基因编码）控制成熟辅助性 T 细胞的稳态和分化，同时反对它们向肠粘膜中的 CD4 上皮内淋巴细胞 (IEL) 分化。因此，CD4 IEL 分化需要通过再激活来抑制 ThPOK 转录。
环境富集保留了老年小鼠海马体中年轻的 DNA 甲基化景观 Zocher S. 等人。衰老过程中大脑功能的下降与表观遗传变化有关，包括 DNA 甲基化。生活方式干预可以改善衰老过程中的大脑功能，但它们对与年龄相关的表观遗传变化的影响尚不清楚。使用全基因组 DNA 甲基化测序，我们在这里表明，体验...
肌节功能会激活 p53 依赖性 DNA 损伤反应，从而促进多倍体化并限制体内细胞植入。 Pettinato, Anthony M. 等人。人类心脏再生受到心肌细胞复制率低和机制不明的渐进多倍体化的限制。为了研究这一过程，我们设计了一个人类心肌细胞模型，使用荧光标记的细胞周期蛋白 B1 和心肌肌钙蛋白 T 来跟踪复制和多倍体化。使用延时 i...
VPRBP 在雄激素受体和 OGT 下游发挥作用限制 p53 激活前列腺癌中的离子 Poulose N. 等人。雄激素受体 (AR) 是前列腺癌 (PCa) 发生和进展的主要驱动因素。 O-GlcNAc 转移酶 (OGT) 是一种催化 UDP-N-乙酰葡糖胺 (UDP-GlcNAc) 共价加成到蛋白质丝氨酸和苏氨酸残基的酶，通常在 PCa 中上调，其表达与...
BAF 复合物在融合阳性横纹肌肉瘤 Laubscher 等人中驱动增殖并阻断肌原性分化。 al.Rhabdomyosarcoma (RMS) 是一种骨骼肌谱系的儿科恶性肿瘤。侵袭性肺泡亚型的特征在于分别编码 PAX3- 或 PAX7-FOXO1 嵌合转录因子的 t(2;13) 或 t(1;13) 易位，被称为融合阳性 RMS (FP-RMS)。融合基因改变...
表观遗传调节因子 RINF (CXXC5) 在人类未成熟红细胞中维持 SMAD7 表达并维持红细胞扩张。 Astori A. et al. The gene CXXC5, encoding a Retinoid-Inducible Nuclear Factor (RINF)，位于骨髓增生异常综合征 (MDS) 和成人急性髓性白血病 (AML) 中通常缺失的 5q31.2 区域内。 RINF 可作为表观遗传调节因子，并已被提议作为造血系统恶性肿瘤的肿瘤抑制因子。然而...
ΔNp63 是结合不可接近的染色质和诱导染色质重塑的先驱因子 Yu X. 等人。背景：ΔNp63 是一种主要的转录调节因子，在表皮发育和其他细胞过程中发挥关键作用。最近的研究表明，ΔNp63 作为先驱因子发挥作用，可以靶向其在难以接近的染色质中的结合位点并诱导染色质重塑。方法：I...
RUNX3 甲基化在早期肿瘤发生中驱动缺氧诱导的细胞增殖和抗细胞凋亡。 Lee、Sun Hee 和 Hyeon、Do Young 和 Yoon、Soo-Hyun 和 Jeong、Ji-Hak 和 Han、Saeng-Myung 和 Jang、Ju-Won 和 Nguyen、Minh Phuong 和 Chi、Xin-Ziand An、Sojin 和 Hyun，Kyung-Gi 和 Jung、Hee-Jung 和 Song、Ji-Joon 和 Bae、Suk-Chul 和 Kim、Woo-Ho 和肿瘤抑制因子 Runt 相关转录因子 3 (RUNX3) 的失活在早期肿瘤发生过程中起着重要作用。然而，基于翻译后修饰 (PTM) 的缺氧条件下 RUNX3 失活机制仍未完全了解。在这里，我们展示了一种机制，即 G9a、赖氨酸-...
性染色体之战：X 和 Y 染色体编码蛋白之间为伴侣相互作用和染色质占据驱动多拷贝基因表达和进化的竞争鼠类啮齿动物。 Moretti、C 和 Blanco、M 和 Ialy-Radio、C 和 Serrentino、ME 和 Gobé、C 和 Friedman、R 和 Battail、C 和 Leduc、M 和 Ward、MA 和 Vaiman、Dand Tores、F 和 Cocquet、JTransmission 失真器（ TDs) 是有利于自身传播而不利于他人的遗传因素。 Slx/Slxl1 (Sycp3-like-X-linked 和 Slx-like1) 和 Sly (Sycp3-like-Y-linked) 是已经co-amp的TDlified 在 Mus 物种的 X 和 Y 染色体上。它们涉及...
BRD4 功能失调是 MeCP2 突变神经元功能异常的基础。 Xiang Y、Tanaka Y、Patterson B、Hwang SM、Hysolli E、Cakir B、Kim KY、Wang W、Kang YJ、Clement EM、Zhong M、Lee SH、Cho YS、Patra P、Sullivan GJ、Weissman SM、Park IHRett综合征 (RTT) 主要由甲基-CpG 结合蛋白 2 (MeCP2) 的突变引起，是最普遍的智力障碍之一，没有有效的治疗方法。在这里，我们使用 2D 和 3D 人脑培养物来研究 MeCP2 功能。我们发现 MeCP2 突变导致人类间质发生严重异常。
由 OCT4 介导的 MYC 转录激活是神经母细胞瘤中 13-cisRA 介导的分化的抗性机制。 Wei SJ、Nguyen TH、Yang IH、Mook DG、Makena MR、Verlekar D、Hindle A、Martinez GM、Yang S、Shimada H、Reynolds CP、Kang MH 尽管 13-c 的临床结果有所改善异维甲酸 (13-cisRA) + 抗 GD2 抗体 + 细胞因子免疫疗法在第一时间给予 ~40% 的高危神经母细胞瘤患者死于复发性疾病。 MYCN 基因组扩增是儿童癌症神经母细胞瘤中侵袭性肿瘤的生物标志物...
使用 DISCOVER-seq 进行 CRISPR 脱靶检测。 Wienert B、Wyman SK、Yeh CD、Conklin BR、Corn JEDISCOVER-seq（发现原位 Cas 脱靶并通过测序验证）是一种广泛适用的方法，用于在细胞和组织中进行无偏倚的 CRISPR-Cas 脱靶识别。在使用 CRISPR 核酸酶进行基因组编辑后，它利用 DNA 修复因子募集到双链断裂 (DSB)。 Her...
LncRNA np_5318通过TGF-β/Smad信号通路促进肾缺血再灌注损伤 卢静,苗建刚,孙建华 龙非编码(Lnc)RNA np_5318已被证明参与肾损伤，而其在肾缺血再灌注 (I/R) 损伤中的功能尚不清楚。为此e，本研究旨在探讨lncRNA np_5318在肾I/R损伤发展中的作用。肾 I/R 损伤模型和 I/R 细胞模型...
细胞保护性热休克因子 1 的促死亡信号：NOXA 上调导致热敏细胞凋亡。 Janus P、Toma-Jonik A、Vydra N、Mrowiec K、Korfanty J、Chadalski M、Widłak P、Dudek K、Paszek A、Rusin M、Polańska J、Widłak 小麦休克可诱导细胞保护机制或细胞死亡。我们发现在某些人类和小鼠细胞中，包括精母细胞，激活的热休克因子 1 (HSF1) 与位于 PMAIP1 (NOXA) 基因内含子的序列结合，并上调其表达，从而诱导细胞凋亡。这种模式...
17-雌二醇通过 ER 阳性乳腺癌细胞中的 MAPK 信号激活 HSF1。 Vydra N、Janus P、Toma-Jonik A、Stokowy T、Mrowiec K、Korfanty J、Długajczyk A、Wojtaś B、Gielniewski B、Widłak 小麦休克因子 1 (HSF1) 是基因表达的关键调节因子在使细胞存活的急性环境压力期间，这也涉及不同的癌症相关过程。雌激素受体 (ER) 阳性乳腺癌患者的高水平 HSF1 与较差的预后相关。在这里，我们...
癌症驱动因素与调节种系变异体的合作塑造了临床结果。 Musa J, Cidre-Aranaz F, Aynaud MM, Orth MF, Knott MML, Mirabeau O, Mazor G, Varon M, Hölting TLB, Grossetête S, Gartlgruber M, Surdez D, Gerke JS, Ohmura S, Marchetto A, Dallmayer M, Baldauf MC、Stein S、Sannino G、Li J、Romero-Pérez L、Westermann F、Hart 小儿恶性肿瘤，包括尤因肉瘤 (EwS)，除了不能解释临床结果的明显变化的特征性驱动突变外，缺乏体细胞改变。在这里，我们在 EwS 中展示了显性致癌基因和调节种系变异体的合作如何决定肿瘤生长，...
弓形虫效应器 TEEGR 通过 mod 促进寄生虫持续存在通过 EZH2 调节 NF-κB 信号。 Braun L、Brenier-Pinchart MP、Hammoudi PM、Cannella D、Kieffer-Jaquinod S、Vollaire J、Josserand V、Touquet B、Couté Y、Tardieux I、Bougdour A、Hakimi MA宿主（包括人类）策略驱动其在宿主中的准无症状持久性，从而优化传播到新宿主的机会。持久性，从逃避宿主免疫杀伤的一小部分寄生虫开始......
预先形成的染色质拓扑有助于肢体发育过程中的转录稳健性。 Paliou C、Guckelberger P、Schöpflin R、Heinrich V、Esposito A、Chiariello AM、Bianco S、Annunziatella C、Helmuth J、Haas S、Jerković I、Brieske N、Wittler L、Timmermann B、Nicodemi M、Vingron M、Mundlos S , Andrey GLong-range gene regulation involves physical proximity between enhancer and promoters to generate precise patterns of gene expression in space and time。但是，在某些情况下，公关oximity 与基因激活同时发生，而在其他情况下，预先形成的拓扑结构在激活之前已经存在。在这项研究中，我们发现...
NRG1 是 TP63 驱动的鳞状细胞癌分化的关键调节因子。 Hegde GV、de la Cruz C、Giltnane JM、Crocker L、Venkatanarayan A、Schaefer G、Dunlap D、Hoeck JD、Piskol R、Gnad F、Modrusan Z、de Sauvage FJ、Siebel CW、Jackson ELS鳞状细胞癌 (SCC) 帐户对于大多数癌症死亡。尽管 TP63 是 SCC 中已确定的谱系存活癌基因，但尚未开发针对 TP63 或其下游效应子的治疗策略。在这项研究中，我们证明 TP63 直接调节 h...
使用 CRISPR/Cas9 优化基因敲除的指南 Campenhout CV 等人。CRISPR/Cas9 技术已经发展成为最强大的方法来生成用于基础研究和临床前研究的遗传模型。尽管表面上看起来很简单，但 genome-e 的结果技术参数和生物学因素会极大地影响数字化实验。在这里，我们提出...
MYC 表达的维持促进去势抵抗性前列腺癌对 BET 溴结构域抑制的从头抵抗。 Coleman DJ、Gao L、Schwartzman J、Korkola JE、Sampson D、Derrick DS、Urrutia J、Balter A、Burchard J、King CJ、Chiotti KE、Heiser LM、Alumkal JJBET 溴结构域蛋白 BRD4 是调节转录的染色质阅读器，包括癌症。具体而言，在前列腺癌中，BET 溴结构域抑制的抗肿瘤活性主要与雄激素受体 (AR) 功能的抑制有关。 MYC 是 BRD4 目标基因，在...
糖皮质激素受体和早期生长反应蛋白 1 之间的串扰解释了脑源性神经营养因子转录物 4 表达的抑制。 Chen H、Amazit L、Lombès M、Le Menuet D脑源性神经营养因子 (BDNF) 是文胸的关键参与者在突触可塑性、压力和行为等功能中。它在啮齿动物中的基因结构包含 8 个未翻译的外显子（I 至 VIII），其表达受到精细调节，并剪接在一个共同且独特的翻译外显子 IX 上。改变的 Bdnf e...
糖皮质激素刺激下丘脑强啡肽表达，导致排卵前应激诱导的 GnRH 分泌受损。 Ayrout M、Le Billan F、Grange-Messent V、Mhaouty-Kodja S、Lombès M、Chauvin S 应激诱导的生殖功能障碍通常与糖皮质激素 (GC) 水平升高相关，后者会导致 GnRH/LH 分泌受抑制和排卵受损。除了下丘脑 kisspeptin 系统的主要作用外，其他关键监管机构可能参与此类监管机制。在此，我们...
EZH2/TET1 的表观遗传协同失调是三阴性乳腺癌中的一种抗衰老、可采取行动的漏洞。 Yu Y, Qi J, Xiong J, Jiang L, Cui D, He J, Chen P, Li L, Wu C,Ma T, Shao S, Wang J, Yu D, Zhou B, Huang D, Schmitt CA, Tao R 三阴性乳腺癌 (TNBC) 细胞缺乏 ER、PR 和 HER2 的表达。因此，TNBC患者不能像非TNBC患者那样从激素受体靶向治疗中获益，只能接受化疗作为全身治疗，总体结局较差。更有效的治疗靶点和组合...
长链非编码 RNA 和核副啄木鸟在热休克反应中被转录因子 HSF1 上调。 Lellahi SM、Rosenlund IA、Hedberg A、Kiær LT、Mikkola I、Knutsen E、Perander M长链非编码 RNA (lncRNA)（核富集丰富转录本 1）是核副啄木鸟的结构组成部分，它最近受到了相当大的关注，因为它在癌症和神经退行性疾病等病理条件下异常表达。和副啄木鸟的形成增加了...
芳基烃受体信号细胞本质上抑制肠组2 先天性淋巴细胞功能。 Li S, Bostick JW, Ye J, Qiu J, Zhang B, Urban JF, Avram D, Zhou 淋巴样细胞 (ILC) 对粘膜免疫很重要。肠道包含所有 ILC 亚群，但这些细胞如何平衡以实现免疫稳态并在感染期间产生适当的反应仍然难以捉摸。在这里，我们表明肠道中的芳烃受体 (Ahr) 表达调节 I...
RRAD、IL4I1、CDKN1A 和 SERPINE1 基因可能受 NF-κB 和 p53 转录因子共同调节暴露于高剂量电离辐射的细胞。 Szołtysek K、Janus P、Zając G、Stokowy T、Walaszczyk A、Widłak W、Wojtaś B、Gielniewski B、Cockell S、Perkins ND、Kimmel M、Widlak P背景：细胞对电离辐射的反应涉及 p53 依赖性通路的激活和非典型 NF-κB 通路的激活。这两个转录网络之间的串扰包括共同基因靶标的（共同）调节。我们在这里寻找 novel 基因可能（共同）受...
H3K4me2 和 WDR5 富集染色质相互作用的长非编码 RNA 在不同的转录单位维持转录能力染色质。 Subhash S、Mishra K、Akhade VS、Kanduri M、Mondal T、Kanduri C 最近，lncRNA 已通过染色质重塑基因的基因组靶向参与真核基因组的亚区室化。为了探索 lncRNA 在维持活性染色质中的功能，我们使用染色质 RNA 免疫预纯化法对富含 H3K4me2 和 WDR5 的染色质中的 lncRNA 进行了表征。
长链非编码 RNA NEAT1 和核副啄木鸟被上调通过热休克反应中的转录因子 HSF1。 Lellahi SM、Rosenlund IA、Hedberg A、Kiær LT、Mikkola I、Knutsen E、Perander M长链非编码 RNA (lncRNA) NEAT1 是核副啄木鸟的结构组成部分，最近受到了相当大的关注，因为它在病理学中异常表达条件成功h 作为癌症和神经退行性疾病。暴露后细胞中 NEAT1 和副啄木鸟形成增加。
ΔNp63 驱动的骨髓来源抑制细胞募集促进三阴性乳腺癌的转移。 Kumar S, Wilkes DW, Samuel N, Blanco MA, Nayak A, Alicea-Torres K, Gluck C, Sinha S, Gabrilovich D, Chakrabarti R 三阴性乳腺癌 (TNBC) 具有特别强的侵袭性，肿瘤复发率和耐药性增加化疗和转移。由于这种侵袭性表型的机制基础尚不清楚，因此治疗选择有限。在这里，我们展示了更多的骨髓源性免疫支持...
事实为秀丽隐杆线虫和人类细胞中的细胞命运重编程设定了障碍。 Kolundzic E, Ofenbauer A, Bulut SI, Uyar B, Baytek G, Sommermeier A, Seelk S, He M, Hirsekorn A, Vucicevic D, Akalin A, Diecke S, Lacadie SA, Tursun B染色质调节剂 FACT（促进染色质转录）是对电子必不可少通过促进转录确保稳定的基因表达。在使用秀丽隐杆线虫进行的遗传筛选中，我们发现 FACT 维持细胞身份并作为转录因子介导的细胞命运再生的屏障...
阿尔茨海默氏病相关的 TREM2 基因受 p53 肿瘤调控抑制蛋白。 Zajkowicz A、Gdowicz-Kłosok A、Krześniak M、Janus P、Łasut B、Rusin MTREM2 突变引起神经退行性疾病，最近该基因的遗传变异与阿尔茨海默病风险增加相关。源自 TREM2 膜受体的信号级联包括其结合伙伴 TYROBP、BLNK 衔接蛋白和 SYK 激酶，它们可以被激活...
全基因组关联研究确定了多个与尤文肉瘤相关的新位点易感性。 Machiela MJ、Grünewald TGP、Surdez D、Reynaud S、Mirabeau O、Karlins E、Rubio RA、Zaidi S、Grossetete-Lalami S、Ballet S、Lapouble E、Laurence V、Michon J、Pierron G、Kovar H、Gaspar N、Kontny U、González-Neira A、Picci P、Alonso J、Patino-Garcia A、CorraEwing 肉瘤 (EWS) 是一种以 EWSR1-FLI1 融合为特征的儿科癌症。我们对 733 个 EWS 病例和 1346 个未受影响的欧洲血统个体进行了全基因组关联研究。我们的研究复制了先前报道的 1p36.22、10q21.3 和 15q15.1 易感位点，并确定了新的位点 a...
甲基-CpG 结合蛋白 2 介导硬皮病成纤维细胞的抗纤维化作用。 He Y, Tsou PS, Khanna D, Sawalha AHOBJECTIVE：新出现的证据支持表观遗传调控在硬皮病 (SSc) 发病机制中的作用。我们旨在评估甲基 CpG 结合蛋白 2 (MeCP2)（一种关键的表观遗传调节因子）在 SSc 成纤维细胞活化和纤维化中的作用。方法：真皮成纤维细胞是从患有...的患者中分离出来的。
BRG1/SOX9 轴对于腺泡细胞衍生的胰腺肿瘤发生至关重要。 Tsuda M、Fukuda A、Roy N、Hiramatsu Y、LeonhardtL、Kakiuchi N、Hoyer K、Ogawa S、Goto N、Ikuta K、Kimura Y、Matsumoto Y、Takada Y、Yoshioka T、Maruno T、Yamaga Y、Kim GE、Akiyama H、Ogawa S、Wright CV、Saur D、 Takaori K、Uemoto S、Hebrok M、Chiba T、SenoChromatin 重塑 Brahma 相关基因 1 (BRG1) 在大约 10% 的人类胰腺导管腺癌 (PDA) 中被沉默。我们之前表明 BRG1 抑制导管内胰腺粘液性肿瘤 (IPMN) 的形成，并且 IPMN 衍生的 PDA 起源于导管细胞。然而，BR...
Wnt 受体 Frizzled 8 是前列腺癌中 ERG 的靶标 Balabhadrapatruni V. S. K. Chakravarthi 等人。前列腺癌 (PCa) 是男性中最常见的癌症之一。在 PCa 进展过程中详细描述了许多分子变化。编码转录因子 ERG 的基因显示反复重排，导致 ERG 在大多数前列腺癌中过度表达。过度表达 o...
促炎细胞因子和 h高剂量的电离辐射对 NF-kappaB 依赖性基因的表达有相似的影响。 Janus P、Szołtysek K、Zając G、Stokowy T、Walaszczyk A、Widłak W、Wojtaś B、Gielniewski B、Iwanaszko M、Braun R、Cockell S、Perkins ND、Kimmel M、Widlak PNF-κB 转录因子通过多种方式激活响应各种类型刺激的分子机制。与特定靶基因组相关的大量功能可能受该因素的不同调节，影响细胞对压力的反应，包括抗癌治疗...
UTX 介导的增强子和染色质重塑通过非催化作用抑制髓样白血病发生ETS 和 GATA 计划的逆向监管。 Gozdecka M、Meduri E、Mazan M、Tzelepis K、Dudek M、Knights AJ、Pardo M、Yu L、Choudhary JS、Metzakopian E、Iyer V、Yun H、Park N、Varela I、Bautista R、Collord G、Dovey O , Garyfallos DA, De Braekeleer E, Kondo S, Cooper J, Göttgens B, Bullinger L, NorthcThe 组蛋白 H3 Lys27 特异性去甲基化酶 UTX（或 KDM6A）是多种癌症中功能丧失突变的目标。在这里，我们证明 UTX 通过非催化功能抑制骨髓性白血病的发生，这是与其催化失活的 Y 染色体旁系同源物 UTY（或 KDM6C）共有的特性。为了保持...
皮质类固醇受体采用不同的周期性转录特征 Florian Le Billan, Larbi Amazit, Kevin Bleakley, Qiong-Yao Xue, Eric Pussard, Christophe Lhadj, Peter Kolkhof, Say Viengchareun, Jérôme Fagart,和 Marc Lombès 盐皮质激素受体 (MRs) 和糖皮质激素受体 (GRs) 是两个密切相关的激素激活转录因子，可调节主要的病理生理功能。这些受体之间的高度同源性解释了它们相应配体的交叉结合，MR 被两种醛固醇激活...
皮质类固醇受体采用不同的周期性转录特征。 Le Billan F、Amazit L、Bleakley K、Xue QY、PussardE、Lhadj C、Kolkhof P、Viengchareun S、Fagart J、Lombès M 盐皮质激素受体 (MRs) 和糖皮质激素受体 (GRs) 是调节主要病理生理功能的两种密切相关的激素激活转录因子。这些受体之间的高度同源性解释了它们相应配体的交叉结合，MR 被醛固酮激活...
Bcl11b，一种新型 GATA3 相互作用蛋白，抑制 Th1，同时限制 Th2 细胞分化。 Fang D、Cui K、Hu G、Gurram RK、Zhong C、Oler AJ、Yagi R、Zhao M、Sharma S、Liu P、Sun B、Zhao K、Zhu JGATA 结合蛋白 3 (GATA3) 作为主转录2 型 T 辅助 (Th2) 细胞分化和功能的因子。然而，GATA3 功能如何在 Th2 细胞中被精确调节仍然是个谜。在这里，我们展示了转录因子 B 细胞淋巴瘤 11b (Bcl11b)，一种以前未知的成分...
皮质类固醇受体采用不同的周期性转录特征 Florian LeBillan, Larbi Amazit, Kevin Bleakley, Qiong-Yao Xue, Eric Pussard, Christophe Lhadj, Peter Kolkhof, Say Viengchareun, Jérôme Fagart, and Marc Lombès 盐皮质激素受体 (MRs) 和糖皮质激素受体 (GRs) 是两个密切相关的激素激活转录因子调节主要的病理生理功能。这些受体之间的高度同源性解释了它们相应配体的交叉结合，MR 被两种醛固醇激活...
皮质类固醇受体采用不同的周期性转录特征 Florian Le Billan、Larbi Amazit、Kevin Bleakley、Qiong-Yao Xue、Eric Pussard、Christophe Lhadj、Peter Kolkhof、Say Viengchareun、Jérôme Fagart 和 Marc Lombès 盐皮质激素受体 (MRs) 和糖皮质激素受体 (GRs) 是两个密切相关的激素激活转录因子，可调节主要病理生理功能。这些受体之间的高度同源性解释了它们相应配体的交叉结合，MR 是由醛固酮激活...
促炎细胞因子和高剂量电离辐射对 NF-kappaB 依赖性基因的表达具有相似的作用 Janus 等人通过多种分子机制激活 NF-κB 转录因子对各种刺激的反应。与特定靶基因组相关的大量功能可能受该因素的不同调节，影响细胞对压力的反应，包括抗癌...
DNA 甲基化特征遵循心肌细胞 Nothjunge S 中预先形成的染色质区室。等人在受限核空间中存储染色质需要密集包装，同时确保 DNA 可及性。因此，存在不同层次的染色质组织和表观遗传控制机制。全基因组染色质相互作用图揭示了大相互作用域 (TAD) 和更高阶的 A 和 B 区室，r...
MYC 驱动前列腺癌中端粒酶 RNA (hTR/TERC) 的过表达r Baena-Del Valle JA 等人。端粒酶至少由两个基本元素组成，一个是包含端粒 DNA 添加模板的 RNA 成分 hTR 或 TERC，另一个是催化逆转录酶 (TERT)。虽然 TERT 的表达被认为是端粒酶活性的关键限速成分，但越来越多的证据表明......
MYC 驱动前列腺癌 Baena-Del Valle 中端粒酶 RNA (hTR/TERC) 的过度表达， J.A., Zheng, Q., Esopi, D.M., Rubenstein, M., Hubbard, G.K., Moncaliano, M.C., Hruszkewycz, A., Vaghasia, A., Yegnasubramanian, S., Wheelan, S.J., Meeker, A.K., Heaphy, C.M. , Graham, M. K. 和 De Marzo, A. M. 端粒酶至少由两个基本元素组成，一个是包含端粒 DNA 添加模板的 RNA 成分 hTR 或 TERC，另一个是催化逆转录酶 (TERT)。虽然 TERT 的表达被认为是端粒酶活性的关键限速成分，但越来越多的证据表明...
复杂的 g左心发育不全综合征的麻醉学 Liu X. 等人。先天性心脏病 (CHD) 影响高达 1% 的活产。尽管复发风险增加表明遗传病因，但偶发发生表明先天性心脏病的遗传学是复杂的。在这里，我们表明左心发育不全综合征 (HLHS) 是一种严重的冠心病，具有多基因和遗传异质性。我们...
p63 的进化重新布线和角质形成细胞中的表观基因组调控景观及其对物种特异性基因表达和表型的潜在影响 Sethi I. 等人。尽管表皮角质形成细胞的发育和分化在人类和老鼠之间的时尚相似，进化压力也造成了显着的物种特异性生理差异。物种间的这些差异部分可能是由于调节网络的重新布线引起的。
糖皮质激素受体抑制神经元样细胞中脑源性神经营养因子的表达 Chen H.等人。脑源性神经营养因子 (BDNF) 参与神经元生长、存活、突触可塑性和记忆等许多功能。改变的表达水平与许多病理情况有关，例如抑郁症、癫痫症、阿尔茨海默氏症、亨廷顿氏症和帕金森氏病。糖皮质激素 r...
人类基因组中驯化水手转座酶与染色体结合的第一个景观：两种结肠直肠细胞系中 SETMAR 亚型的基因组靶标的多样性 Antoine-Lorquin A. 等人。Setmar 是编码与 Hsmar1 转座酶融合的 SET 结构域的 3 外显子基因。其不同的转录本理论上编码 8 种亚型，SET 部分的剪接方式不同。在体外，最大的亚型与 Hsmar1 DNA 末端特异性结合，当它与 hPso4 结合时对 DNA 没有特异性。在结肠癌中...
四聚化小分子抑制剂 Schanda J. et al.RUNX1/ETO 对 RUNX1/ETO 致癌活性的抑制，产品 of t(8;21) 染色体易位是一种最常见的急性髓性白血病 (AML) 的发作和维持所必需的。 RUNX1/ETO 具有模块化结构，除 DN A 结合域 (Runt) 外，还包含四个进化保守功能域，命名为 nerv...
Foxo3 转录因子通过诱导致病性 T 辅助细胞 1 分化Eomes Stienne C. 等人的表达转录因子 Foxo3 在骨髓细胞功能中起着至关重要的作用，但其在淋巴细胞中的作用仍不清楚。在这里，我们已经表明，Foxo3 表达在 T 细胞受体参与后增加，并在 CD4+ T 细胞向致病性 T 细胞的极化中发挥特定作用...
cohesin 复合物成分 STAG2 或 STAG3 的缺失赋予对黑色素瘤中的 BRAF 抑制 Shen CH 等人。蛋白激酶 B-Raf 原癌基因丝氨酸/苏氨酸激酶 (BRAF) 是黑色素瘤的致癌驱动因素和治疗靶点。抑制剂of BRAF (BRAFi) 在患有黑色素瘤的患者中表现出高反应率和延长的生存期，这些患者的肿瘤表达编码 BRAF 蛋白突变的突变在 Val600，......
霉菌毒素黄曲霉毒素 B1 刺激 Epstein-Barr 病毒-在体外和体内实验模型中诱导 B 细胞转化Glehen, F.-L. Cosset、E. Manet、C. P. Wild 和 M. Tommasino 尽管 EB 病毒 (EBV) 感染分布广泛，但某些 EBV 驱动的恶性肿瘤在地理上受到限制。 EBV 相关伯基特淋巴瘤 (eBL) 在生活在撒哈拉以南非洲的儿童中流行。该人群严重暴露于被霉菌毒素黄曲霉毒素污染的食物...
BET 蛋白抑制通过减弱 MGMT 表达 TancrediA 使胶质母细胞瘤细胞对替莫唑胺治疗敏感。 et al.Bromodomain and extra-terminal tail (BET) 蛋白已被识别被确定为癌症的潜在表观遗传靶标，包括胶质母细胞瘤。这些表观遗传修饰剂将组蛋白密码与基因转录联系起来，而基因转录可以被小分子 BET 抑制剂 (BETi) 破坏。以开发合理组合为目的...
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C01019027×ChIP Cross-link Gold C15100055-100×Pol II Antibody C01010051×iDeal ChIP -seq 组蛋白试剂盒 B01080010获取报价您即将请求 Bioruptor® Pico 的报价超声处理装置。填写下表，我们会尽快与您联系。
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Diagenode 的iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒是一种经过高度验证的稳健转录解决方案因子和其他非组蛋白 ChIP-seq 结果并包含您从开始到结束所需的一切 ChIP 之前 下一代测序。这个完整的解决方案包含用于细胞裂解、染色质剪切、免疫沉淀和 DNA 纯化的所有缓冲液和试剂。此外，与竞争解决方案不同，该试剂盒包含阳性和阴性对照抗体（分别为 CTCF 和 IgG）以及阳性和阴性对照 PCR 引物对（分别为 H19 和肌红蛋白外显子 2），以方便您使用并保证获得最佳结果. iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒 与细胞或组织兼容： iDeal ChIP-seq 试剂盒是市场上唯一经过主要测序系统验证的试剂盒。我们在 ChIP-seq 工具方面的专业知识可确保每次都能获得可重复且高效的结果。 图 1. (A) 染色质免疫沉淀已使用来自 HeLa 细胞的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq 级 CTCF 抗体进行了转化。随后在 Illumina® HiSeq 上分析经过 IP 处理的 DNA。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。该图显示了 GAPDH 阳性对照基因周围区域的峰分布。 图 1B. 本实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到前 40% 的成岩节点峰与参考数据集之间的完美匹配。基于 NIH 编码项目ct 标准，如果前 40% 的峰与比较数据集的重叠率至少为 80%，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间可重现。 图 2. 使用 chrom 进行染色质免疫沉淀来自 HeLa 细胞的 atin、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq 级 HDAC1 (A)、LSD1 (B) 和 p53 抗体 (C)。随后在 Illumina® 基因组分析仪上分析经过 IP 处理的 DNA。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。此图分别显示了 3 号染色体（A）、12 号染色体（B）和 6 号染色体（C）区域的峰值分布。 图 3A. 使用来自小鼠肝组织的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和成岩节点进行染色质免疫沉淀ChIP-seq 级 CTCF 抗体。随后在 Illumina® 上分析经过 IP 处理的 DNA。 HiSeq。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。该图显示了 Vwf 阳性对照基因周围区域的峰值分布。 图 3B. 本实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到前 40% 的成岩节点峰与参考数据集之间的完美匹配。根据 NIH Encode 项目标准，如果前 40% 的峰具有至少 80% 的重叠，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间是可重现的ap 比率与比较的数据集。 用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与种类繁多的细胞系、组织和物种——部分示例如下所示。其他物种/细胞系/组织可与该试剂盒一起使用。 细胞系： 人类： A549、A673、BT-549、CD4 T、HCC1806、HeLa、HepG2、HFF、HK-GFP-MR、ILC、K562、KYSE-180、LapC4、M14、MCF7、MDA-MB-231、MDA-MB -436, RDES, SKNO1, VCaP, U2-OS, ZR-75-1 ; 小鼠：ESC、NPC、BZ、GT1-7、腺泡细胞、HSPC、Th2细胞、角质形成细胞 Cattle: pbMEC, MAC-T 其他细胞系/物种：兼容，未测试 组织： 小鼠：肾脏、心脏、大脑、虹膜、肝脏、E10.5胚胎的四肢 马: liver, brain, heart, lung, skeletal muscle, lamina, ovary 其他组织：兼容，未测试 酵母 ChIP 用于 TF 的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与酵母样本兼容。查看我们的应用说明展示优化的详细信息酵母 ChIP 协议。 您是否使用 iDeal ChIP-seq for Transcripti在其他细胞系/组织/物种上使用 Factors Kit？ 让我们知道！ 染色质 EasyShear 试剂盒 –低 SDS 该试剂盒与用于 TF 的 iDeal ChIP-seq 试剂盒兼容，推荐用于优化染色质剪切，这是 ChIP 的关键步骤。 ChIP 交联Gold 在处理高阶和/或动态相互作用时，应与甲醛结合使用，以实现高效的蛋白质-蛋白质固定。 对于免疫沉淀样品的文库制备，我们建议使用 MicroPlex 文库制备试剂盒 - 从皮克图输入验证了文库制备。 ChIP-seq 级抗体提供高产量具有出色的特异性和灵敏度。 检查可用列表 引物对专为特定基因组区域的高特异性而设计。 此外，我们的 IP-Star Automation 自动化 ChIP 用户，请查看我们的 此套件的自动化版本。 Diagenode 的 iDeal 芯片序列转录因子试剂盒 是一种经过高度验证的解决方案，适用于稳健的转录因子和其他非组蛋白蛋白质 ChIP-seq 结果，包含您从头到尾完成 ChIP 所需的一切在下一代测序之前。这个完整的解决方案包含用于细胞裂解、染色质剪切、免疫沉淀和 DNA 纯化的所有缓冲液和试剂。此外，与竞争解决方案不同，该试剂盒包含阳性和阴性对照抗体（分别为 CTCF 和 IgG）以及阳性和阴性对照 PCR 引物对（分别为 H19 和肌红蛋白外显子 2），以方便您使用并保证获得最佳结果. iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒tors 与细胞或组织兼容： iDeal ChIP-seq 试剂盒是市场上唯一经过验证可用于主要测序系统的试剂盒。我们的电子ChIP-seq 工具的专业知识每次都能获得可重复且高效的结果。 图 1. (A) 使用来自 HeLa 细胞的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP- seq 级 CTCF 抗体。IP\'d DNA 随后在 Illumina® HiSeq 上进行分析。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。该图显示了峰分布在GAPDH 阳性对照基因周围的区域。 图 1B. 本实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到一个完美的Diagenode 峰的前 40% 与参考数据集之间的匹配。根据 NIH Encode 项目标准，如果前 40% 的峰与比较数据集的重叠率至少为 80%，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间可重现。 图 3A. 染色质免疫沉淀已使用来自小鼠肝组织的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq 级 CTCF 抗体。随后在 Illumina® 上分析经过 IP 处理的 DNA。 HiSeq。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。该图显示了 Vwf 阳性对照基因周围区域的峰值分布。 图 3B. 本实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到前 40% 的成岩节点峰与参考数据集之间的完美匹配。基于 NIH Encode 项目标准，ChIP-seq 结果被认为是可重复的如果前 40% 的峰与比较数据集有至少 80% 的重叠率，则原始数据集和复制数据集之间可以推断。 用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与多种细胞系、组织和物种兼容——部分示例如下所示。其他物种/细胞系/组织可与该试剂盒一起使用。 细胞系： 人类： A549、A673、BT-549、CD4 T、HCC1806、HeLa、HepG2、HFF、HK-GFP-MR、ILC、K562、KYSE-180、LapC4、M14、MCF7、MDA-MB-231、MDA-MB -436, RDES, SKNO1, VCaP, U2-OS, ZR-75-1 ; 小鼠：ESC、NPC、BZ、GT1-7、腺泡细胞、HSPC、Th2 细胞、角质形成细胞 牛：pbMEC、MAC-T 组织： 马：肝脏、大脑、心脏、肺、骨骼肌、椎板、卵巢 其他组织：兼容，未测试 ChIP on yeast The用于 TF 的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与酵母样本兼容。查看我们的应用说明展示优化的详细信息协议f或 ChIP on yeast。 您是否在其他细胞系/组织/物种上使用了 iDeal ChIP-seq for Transcription Factors Kit？ 让我们知道！ Chromatin EasyShear Kit – Low SDS该试剂盒是否与 iDeal ChIP-seq 试剂盒兼容TF，推荐用于优化染色质剪切，这是 ChIP 的关键步骤。 ChIP Cross-link Gold 应该是在处理高阶和/或动态相互作用时与甲醛结合使用，以实现高效的蛋白质-蛋白质固定。 用于文库制备我们建议使用 MicroPlex Library Preparation Kit - 经过验证可根据皮克图输入进行文库制备。 ChIP-seq 等级抗体 提供高产量以及出色的特异性和灵敏度。 检查可用列表 引物对专为特定基因组区域的高特异性而设计。 Pl对于我们的IP-Star Automation 自动化 ChIP 用户，请查看我们的此套件的自动化版本。 Diagenode 的iDeal ChIP-seq 转录因子试剂盒 是一种经过高度验证的解决方案，适用于强大的转录因子和其他非组蛋白 ChIP-seq 结果，包含您从头到尾所需的一切 ChIP 在下一代测序之前。这个完整的解决方案包含用于细胞裂解、染色质的所有缓冲液和试剂剪切、免疫沉淀和 DNA 纯化。此外，与竞争解决方案不同，该试剂盒包含阳性和阴性对照抗体（分别为 CTCF 和 IgG）以及阳性和阴性对照 PCR 引物对（分别为 H19 和肌红蛋白外显子 2），用于您的便利和最佳结果的保证。 iDeal ChIP-转录因子序列试剂盒兼容细胞或组织： iDeal ChIP-seq 试剂盒是市场上唯一经过主要测序系统验证的试剂盒。我们在 ChIP-seq 工具方面的专业知识可确保每次都能获得可重复且高效的结果。 span > 图 1. (A) 使用来自 HeLa 细胞的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq-grade 进行染色质免疫沉淀CTCF 抗体。 IP\'d DNA w随后在 Illumina® HiSeq 上进行分析。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。该图显示了 GAPDH 阳性对照基因周围区域的峰分布。 图 1B. 本实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到前 40% 的成岩节点峰与参考数据集之间的完美匹配。根据 NIH Encode 项目标准，如果前 40% 的峰与 compa 有至少 80% 的重叠率，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间是可重现的红色数据集。 图 2. 使用来自 HeLa 细胞的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq-grade HDAC1 (A )、LSD1 (B) 和 p53 抗体 (C)。 IP\'d DNA 是 subsequ在 Illumina® 基因组分析仪上进行了深入分析。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。此图分别显示了 3 号染色体（A）、12 号染色体（B）和 6 号染色体（C）区域的峰值分布。 图 3A. 使用来自小鼠肝组织的染色质、用于转录因子的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq 级 CTCF 抗体进行染色质免疫沉淀.随后在 Illumina® 上分析经过 IP 处理的 DNA。 HiSeq。进行文库制备、簇生成和测序根据制造商的说明。该图显示了 Vwf 阳性对照基因周围区域的峰值分布。 图 3B. 本实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到前 40% 的成岩节点峰与参考数据集之间的完美匹配。根据 NIH Encode 项目标准，如果前 40% 的峰与比较数据集的重叠率至少为 80%，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间可重现。 The iDeal C用于转录因子的 hIP-seq 试剂盒与多种细胞系、组织和物种兼容——部分示例如下所示。其他物种/细胞系/组织可与该试剂盒一起使用。 细胞系： 人类： A549、A673、BT-549、CD4 T、HCC1806、HeLa、HepG2、HFF、HK-GFP-MR、ILC、K562、KYSE-180、LapC4、M14、MCF7、MDA-MB-231、MDA-MB -436, RDES, SKNO1, VCaP, U2-OS, ZR-75-1 ; 小鼠：ESC、NPC、BZ、GT1-7、腺泡细胞、HSPC、Th2细胞、角质形成细胞 牛：pbMEC、MAC-T 其他细胞系/物种：兼容，未测试 组织： 小鼠：肾脏、心脏、大脑、虹膜、肝脏、E10.5胚胎的四肢 马：肝肝、脑、心、肺、骨骼肌、椎板、卵巢 其他组织：兼容，未测试 ChIP on yeast 用于 TF 的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与酵母样本兼容。查看我们的应用说明介绍酵母 ChIP 的优化详细方案。 您是否在其他细胞系/组织/物种上使用了 iDeal ChIP-seq for Transcription Factors Kit？让我们知道！ Chromatin EasyShear Kit – Low SDS 该试剂盒与 iDeal ChIP-seq 试剂盒兼容，推荐用于染色质优化剪切，关键步骤r ChIP。 ChIP Cross-link Gold 在处理更高阶和/或时应与甲醛结合使用动态相互作用，用于有效的蛋白质-蛋白质固定。 对于免疫沉淀样品的文库制备，我们建议使用 MicroPlex Library Preparation Kit - 经过验证可根据皮克图输入进行文库制备。 ChIP-seq 级抗体提供具有出色特异性和灵敏度的高产量。 检查可用列表引物对 专为特定基因组区域的高特异性而设计。 此外，我们的 IP-Star Automation 自动化 ChIP 用户，请查看我们的au此套件的自动化版本。 替代名称： MRD21 兔抗人CTCF（CCCTC-Binding Factor）多克隆抗体，使用4KLH 偶联肽。 新！该抗体已在CUT&Tag中进行验证-验证数据将很快更新。 图 1. 使用针对 CTCF 的 Diagenode 抗体获得的 ChIP 结果ChIP 是使用针对 CTCF 的 Diagenode 抗体（货号 C15410210）对来自 4,000,000 个 HeLa 细胞的剪切染色质进行分析。分析了每个 ChIP 实验由 1、2、5 和 10 µg 抗体组成的滴度。 IgG (2 µg/IP) 用作 IP 阴性对照。定量PCR用为 H19 印记控制区域和 GAPDH 基因中的特定区域优化引物，用作阳性对照，以及用于 Sat2 卫星重复区域，用作阴性对照。图 1 显示了回收率，表示为输入的百分比（免疫沉淀 DNA 与 qPCR 分析后输入 DNA 的相对量）。 A. B. C. D. 图 2. 使用针对 CTCF 的 Diagenode 抗体获得的 ChIP-seq 结果 如上所述，使用 1 µg 的 Diagenode 抗 CTCF 抗体（货号 C15410210）对来自 4,000,000 个 HeLa 细胞的剪切染色质进行 ChIP。随后在 Illumina HiSeq2000 上分析 IP 的 DNA。文库制备，根据制造商的说明进行簇生成和测序。使用 BWA 算法将 50 bp 标签与人类基因组对齐。图 2 显示了沿完整序列和 1 号染色体 1 mb 区域的峰值分布（图 2A 和 B） ) 以及 GAPDH 和 H19 周围的两个区域阳性对照基因，分别（图 2C 和 D）.. A. B. 图 3. 使用针对 CTCF 的 Diagenode 抗体获得的切割和标记结果 CUT&TAG (Kaya-Okur, H.S., Nat Commun 10, 1930, 2019) 使用 1 µg CTCF 成岩节点抗体（目录号 C15410210）和成岩节点在 50,000 个 K562 细胞上进行pA-Tn5 转座酶 (C01070001）。随后根据制造商的说明在 Illumina NextSeq 500 测序仪（2x75 双端读取）上分析这些库。使用 BWA 算法将标签与人类基因组 (hg19) 对齐。图3显示了11号染色体上的h19印记控制基因和2号染色体上的AMER3基因周围2个基因组区域的峰值分布（分别为图3A和B）。 图4.抗体滴度测定 为了确定抗体的滴度，使用针对 CTC 的 Diagenode 抗体的系列稀释液进行 ELISAF（货号 C15410210）。平板用用于免疫兔的肽包被。通过绘制吸光度与抗体稀释度的关系图（图 4），抗体的效价估计为 1:90,000。 图 5. 使用针对 CTCF 的成岩节点抗体进行蛋白质印迹分析 使用针对 CTCF 的 Diagenode 抗体（目录号 C15410210）稀释 1，通过蛋白质印迹分析来自转染 CTCF siRNA（泳道 2）和未转染对照（泳道 1）的 HeLa 细胞的全细胞提取物（40 µg） :1,000 在含有 5% 脱脂牛奶的 TBS-Tween 中。右侧标明了目的蛋白的位置；标记（以 kDa 为单位）显示在左侧。 CTCF （UniProt/Swiss-Prot 条目 P49711）是一种转录调节蛋白，具有 11 个高度保守的锌指结构域。通过使用不同的锌指结构域组合，CTCF 可以结合不同的 DNA 序列和蛋白质。因此，它既可以作为转录抑制因子，也可以作为转录激活因子。通过与转录绝缘子元件结合，CTCF 还可以阻断增强子与上游启动子之间的通讯，从而调节印记基因的表达。 CTCF 还结合 H19 印记控制区并介导母系遗传的高阶染色质构象以限制增强子对 IGF2 的访问。 CTCF 基因的突变与浸润性乳腺癌有关，prost吃了癌症，威尔姆斯吃了癌症。肿瘤。 Alternative names：TP53，P53，TRP53，LSF1 在兔体内产生的针对人 p53（肿瘤蛋白 p53） 的多克隆抗体，使用 KLH 偶联的合成肽，该肽包含来自蛋白质 C 末端部分的序列。 图 1. 使用针对 p53 的 Diagenode 抗体获得的 ChIP 结果; 使用人 U2OS 细胞进行 ChIP 测定，这些细胞经过喜树碱、针对 p53 的成岩节点抗体（目录号 C15410083）和用于 qPCR 的优化 PCR 引物组。 ChIP 是对来自 400 万个细胞的剪切染色质进行的。分析了每个 ChIP 实验的抗体滴度，包括 1、2、5 和 10 µg。 IgG (2 µg/IP) 用作 IP 阴性对照。使用 p21 和 GAS6 基因的引物作为阳性对照，以及 GAPDH 启动子和 Sat2 卫星重复序列的引物作为阴性对照进行 qPCR。图 1 显示了回收率，表示为输入的百分比（免疫沉淀 DNA 与 qPCR 分析后输入 DNA 的相对量）。 A. B. D. strong>图 2. 使用针对 p53 的 Diagenode 抗体获得的 ChIP-seq 结果 ChIP 是使用 1 μg 的针对 p53 的 Diagenode 抗体（目录号 2017）对来自 400 万个 U2OS 细胞的剪切染色质进行的。编号 C15410083) 如上所述。 IP’d DNA 随后在 Illumina HiSeq 上进行分析。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。使用 BWA 算法将 51 bp 标签与人类基因组对齐。图 2 显示了沿 X-chromo 的峰分布一些（图 2A）和 6、13 和 12 号染色体的 3 个基因组区域，围绕 p21 (CDKN1A)、GAS6 和 MDM2，p53 的 3 个已知靶基因（分别为图 2B、C 和 D）。 图3. 抗体效价的测定 效价测定在抗原包被的孔中，使用针对人 p53 的 Diagenode 抗体（目录号 C15410083）的系列稀释液进行 ELISA。通过绘制吸光度与抗体稀释度的关系（图 3），抗体的滴度估计为 1：308,000。 图 4. 使用针对 p53 的成岩节点抗体进行蛋白质印迹分析 使用在含有 5% 脱脂牛奶的 TBS-Tween 中以 1:2,000 稀释的针对 p53 的 Diagenode 抗体（货号 C15410083），通过蛋白质印迹分析 HeLa 细胞的核提取物 (40 µg)。右侧标明了目的蛋白的位置；标记（以 kDa 为单位）显示在左侧。 转录因子 p53（UniProt/Swiss-Prot 条目 P04637）是一种肿瘤抑制因子，可调节细胞对不同细胞应激的反应。激活后，p53 会诱导几种靶基因，导致细胞周期停滞和 DNA 修复，或者导致细胞凋亡。在无应激细胞中，p53 被泛素连接酶 MDM2 保持失活，抑制活性并促进降解。 p53 突变与绝大多数人类癌症有关。 别名：EP300, KAT3B, RSTS2 单克隆抗体小鼠通过DNA免疫接种抗人p300（E1A结合蛋白P300）克隆表达该蛋白的C端部分 图 1. 使用针对 p300 的成岩节点单克隆抗体获得的 ChIP 结果 使用 HeLa 细胞进行 ChIP，即针对 p300 的成岩节点单克隆抗体（目录号 C15200211） ) 和用于 qPCR 的优化 PCR 引物组。 ChIP 是使用\"iDeal ChIP-seq”进行的。试剂盒（目录号 C01010055），使用来自 400 万个细胞的剪切染色质。分析了每个 ChIP 实验的抗体滴度，包括 1、2、5 和 10 μg。 IgG (2 μg/IP) 用作 IP 阴性对照。对 ANKRD32 和 IRS2 基因附近的两个基因组区域的引物进行定量 PCR，用作阳性对照，对失活 MYOD1 基因的编码区域和 11 号染色体上的间质区域用作阴性对照已经控制。图 1 显示了回收率，以输入百分比表示（免疫沉淀 DNA 与 qPCR 分析后输入 DNA 的相对量）。 A. B. C. D. 使用 5 μg 的针对 p300 的成岩节点抗体（目录号）进行 ChIP . C15200211)如上所述，从 400 万个 HeLa 细胞剪切染色质。随后在 Illumina HiSeq 2000 上分析 IP 的 DNA。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。使用 BWA 算法将 50 bp 标签与人类基因组对齐。图 2 显示了沿完整序列和 5 号染色体 3 mb 区域（图 2A 和 B）以及 IRS2 和 ANKRD32 阳性对照基因周围两个区域的峰分布（图 2C 和 D）。用于 ChIP-qPCR 的扩增子的位置用箭头表示。 p300 （UniProt/Swiss-Prot 条目 Q09472）是一种组蛋白乙酰转移酶，可通过染色质重塑调节转录。因此，它对细胞增殖和分化很重要。 p300 能够乙酰化他的所有四个核心核小体中的音调。组蛋白的乙酰化与转录激活有关。 p300 还乙酰化非组蛋白，如 HDAC1，导致其失活和转录调节。它还被确定为 HIF1A（缺氧诱导因子 1 α）的共激活剂，因此在刺激缺氧诱导基因（如 VEGF）中发挥作用。 p300 基因缺陷是 Rubinstein-Taybi 综合征的一个原因，也可能在上皮癌中发挥作用。 交联通常是通过使用甲醛实现的，甲醛形成可逆的 DNA-蛋白质连接。但是，甲醛通常无效在交联中不直接与 DNA 结合的蛋白质。例如，诱导转录因子或辅助因子通过蛋白质-蛋白质相互作用与 DNA 相互作用，以及这些不能用甲醛很好地保存。F或更高阶和/或动态像这样的 ic 相互作用，应考虑其他交联剂以实现有效的蛋白质-蛋白质稳定。 Diagenode 的 ChIP cross-link Gold与甲醛结合使用，是此类高阶蛋白质相互作用的绝佳选择。 替代名称：POLR2A, RPB1, POLR2, RPOL2 在小鼠中产生的针对 RNA 聚合酶 II 的B1 亚基（聚合酶 (RNA) II）的单克隆抗体（ DNA 定向) 小麦胚芽的多肽 A)。与含有 YSPTSPS 重复序列的蛋白质的高度保守的 C 末端结构域相互作用。 \'验证数据\',\'info1\' => \' 图 1. 使用针对 Pol II 的 Diagenode 单克隆抗体获得的 ChIP 结果使用人 HeLa 细胞、针对 Pol II 的 Diagenode 单克隆抗体（目录号 C15100055）和用于 qPCR 的优化 PCR 引物对进行 ChIP 测定。 ChIP 是使用\"iDeal ChIP-seq”进行的。试剂盒（目录号 C01010051），使用来自 100 万个细胞的剪切染色质。每个 ChIP 实验包含 1、2、5 和 10 μl 抗体的滴定nt 进行了分析。 IgG (2 μg/ IP) 用作 IP 阴性对照。使用对 GAPDH 和 EIF4A2 基因启动子特异的引物进行定量 PCR，用作阳性对照，对 MYOD1 基因和 Sat2 卫星重复序列用作阴性对照。图 1 显示了回收率，表示为输入的百分比（免疫沉淀 DNA 与 qPCR 分析后输入 DNA 的相对量）。 图 2. 使用 Diagenode 单克隆抗体获得的 ChIP-seq 结果针对 Pol II 如上所述，使用 2 μl 针对 Pol II 的 Diagenode 抗体（货号 C15100055），对来自 100 万个 HeLaS3 细胞的剪切染色质进行 ChIP。IP’d随后在 Illumina HiSeq 上分析 DNA。根据制造商的说明进行配给、簇生成和测序。使用 BWA 算法将 51 bp 标签与人类基因组对齐。图 2 显示了 X 染色体的完整序列和 1 Mb 区域（图 2A 和 B）以及 12 号和 3 号染色体基因组区域的富集，围绕 GAPDH 和 EIF4A2 阳性对照基因（图 2C 和 D）。 图 3. 使用针对 Pol II 的 Diagenode 单克隆抗体进行蛋白质印迹分析整体使用 Pol II 的 Diagenode 抗体（目录号 C15100055）稀释 1，通过蛋白质印迹分析来自转染 Pol II siRNA（泳道 2）和未转染对照（泳道 1）的 HeLa 细胞的细胞提取物 (40 μg) :500 在含有 5% 脱脂牛奶的 TBS-Tween 中。右侧标明了目的蛋白的位置；标记（以 kDa 为单位）显示在左侧。 RNA聚合酶 II (pol II) 是调节和控制基因转录的关键酶。它能够解开 DNA 双螺旋结构、合成 RNA 并校对结果。 Pol II 是一种复杂的酶，由 12 个亚基组成，其中 B1 亚基（UniProt/Swiss-Prot 条目 P24928）是最大的。 B1 与第二大亚基一起构成 RNA 聚合酶 II 转录机制的催化核心 不要冒险浪费您宝贵的测序样本。Diagenode 经过验证的 iDeal ChIP-seq 组蛋白试剂盒 拥有从开始到结束的成功所需的一切下一代测序前的组蛋白 ChIP。完整的试剂盒包含用于细胞裂解、染色质剪切、免疫沉淀和 DNA 纯化的所有缓冲液和试剂。此外，与竞争解决方案不同，该试剂盒包含阳性和阴性对照抗体（分别为 H3K4me3 和 IgG）以及阳性和阴性对照 PCR 引物对（分别为 GAPDH TSS 和肌红蛋白外显子 2），为您提供便利并保证获得最佳结果。该试剂盒已在多个组蛋白标记上进行了验证。 iDeal ChIP-seq 组蛋白 试剂盒非常适合细胞（每个 IP 100,000 个细胞 到 1,000,000 个细胞）并且已经过验证用于组织（每次 IP 组织 1.5 mg 至 5 mg）。 iDeal ChIP-seq 试剂盒是市场上唯一经过主要测序系统验证的试剂盒。我们在 ChIP-seq 工具方面的专业知识确保每次都能获得可重复且高效的结果。 注意：为获得最佳结果，该试剂盒应与 DiaMag1.5-磁力架结合使用。 图 1A. iDeal ChIP-seq 套件在 Ion Torrent™ PGM™ (Life Technologies) 和 GAIIx (Illumina ®) 使用 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 1 µg H3K4me3 阳性对照抗体对 100 万个 HelaS3 细胞的剪切染色质进行 ChIP。两种不同的生物样品已被使用两种不同的测序仪 - GAIIx (Illumina®) 和 PGM™ (Ion Torrent™) 进行分析。已获得 H3K4me3 在 GAPDH 启动子区域的预期 ChIP-seq 配置文件。 图片A 显示了沿 chr12 的数百个 bp，尽管测序仪完全不同，但读取分布具有高度相似性。图像 B 是一个聚焦于 GAPDH 的近距离捕获，显示即使是 peak 结构相似。 通过 iDeal ChIP-seq 工作流程获得的 ChIP-seq 数据与参考数据集完美匹配 图 1B. 本实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到前 40% 的成岩节点峰与参考数据集之间的完美匹配。根据 NIH Encode 项目标准，如果前 40% 的峰与比较数据集的重叠率至少为 80%，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间可重现。 图 2. 使用 iDeal ChIP-seq 套件中的 Bioruptor® 和剪切缓冲液 iS1 高效、轻松地剪切染色质 使用 Bioruptor® 结合 Bioruptor® 水冷却器（目录号 BioAcc-冷）在 3 轮 10 个循环的 30 秒\"开”/30 秒\"关”在高功率设置（位置 H）。Diagenode 1.5 ml TPX 管（目录号 M-50001）用于染色质剪切。在进行每一轮超声处理（每轮 10 个循环）之前和之后将样品轻轻涡旋，然后在 4°C 下短暂离心以回收管底部的样品体积。剪切的染色质是 t按照试剂盒手册中的说明进行母鸡解交联，并通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。 图 3. 通过 qPCR 验证 ChIP：使用 Diagenode 的 ChIP-seq 级 H3K4me3 抗体、同种型对照和验证集的可靠结果引物 通过 qPCR 检测到阳性位点（GAPDH、EIF4A2、c-fos 启动子区域）的特异性富集与阴性位点（TSH2B 启动子区域和肌红蛋白外显子 2）的无富集相比较。使用 Diagenode iDeal ChIP-seq 试剂盒制备样品。针对 H3K4me3 的成岩节点 ChIP-seq 级抗体和相应的同种型对照 IgG 用于免疫沉淀。用 se 进行 qPCR 扩增ts 验证引物。 图 4A. 使用来自小鼠肝组织的染色质、用于组蛋白的 iDeal ChIP-seq 试剂盒和 Diagenode ChIP-seq-grade H3K4me3（Cat . No. C15410003) 抗体。随后在 Illumina® 上分析经过 IP 处理的 DNA。 HiSeq。根据制造商的说明进行文库制备、簇生成和测序。该图显示了 GAPDH 阳性对照基因周围区域的峰值分布。 图 4B。该实验的 ChIP-seq 数据集已与 Broad Institute 的参考数据集进行了比较。我们观察到前 40% 的成岩节点峰与参考数据集之间的完美匹配。根据 NIH Encode 项目标准，如果前 40% 的峰与比较数据集的重叠率至少为 80%，则认为 ChIP-seq 结果在原始数据集和复制数据集之间可重现。 用于组蛋白的 iDeal ChIP-seq 试剂盒与多种细胞系、组织和物种兼容 - 下面显示了一些示例。此试剂盒可用于其他物种/细胞系/组织。 细胞系： Hu人：A549、A673、CD8+ T、血管内皮细胞、淋巴管内皮细胞、成纤维细胞、K562、MDA-MB231 猪：肺泡巨噬细胞 小鼠：C2C12、原代 HSPC、滑膜成纤维细胞、HeLa-S3、FACS 分选胚胎肾细胞、巨噬细胞、中胚层细胞、成肌细胞、NPC、唾液腺、精子细胞、精母细胞、骨骼肌干细胞、干细胞、Th2 仓鼠：CHO 其他细胞系/物种：兼容，未测试 组织 蜜蜂 – brain 水蚤 –整只动物 马 –大脑、心脏、椎板、肝脏、肺、骨骼肌、卵巢 人类 – Erwing 肉瘤肿瘤样本 其他组织：兼容，未测试 您是否在其他细胞系/组织/物种上使用了 iDeal ChIP-seq for Histones Kit？ 让我们知道！ MicroPlex 文库制备试剂盒提供简单和优化al ChIPed 样品的文库制备。 ChIP-seq 级抗组蛋白抗体 提供高产量具有出色的特异性和灵敏度。 此外，对于我们的 IP-Star Automation 自动化 ChIP 用户，请查看我们的此工具包的自动化版本。 The Bioruptor® Pico 是剪切领域的最新创新，作为一种能够剪切 150 bp 至 1 kb 样品的一体式剪切系统，它代表了一项新的突破。自 2004 年以来，Diagenode 积累了剪切专业知识 设计 Bioruptor® Pico 和保证是在样品制备方面拥有丰富的应用经验——在各个研究领域，包括环境研究、毒理学、基因组学和表观基因组学、癌症研究、干细胞和发育、神经科学、临床应用、农业等等。 Bioruptor Pico 剪切附件和耗材的开发旨在实现样品量的灵活性（20 µl - 2 毫升）和样品的快速并行处理（最多同时处理 16 个样品）。 的内置冷却系统（Bioruptor® Cooler）确保高精度温度控制。 用户友好的界面专为任何研究人员设计，提供了简单和高级的模式，为初学者和有经验的用户提供了适当的控制级别。 此外，Diagenode 还提供经过全面验证的试管，这些试管经济实惠且运营成本低（< 1€/$/DNA 样本）和剪切套件，可实现最佳样本质量。 应用多样性： 在此处查找成岩节点管的数据表 Which tubes for which Bioruptor®? Diagenode 优化了一个成功制备染色质的一系列解决方案。染色质 EasyShear 试剂盒与 Pico 超声波发生器结合了高效细胞裂解和 c染色质剪切，同时保持抗体可接近的表位，对于有效的染色质免疫沉淀至关重要。每个 Chromatin EasyShear Kit 都根据您的特定实验需求提供优化的试剂和经过彻底验证的方案。 SDS 浓度适用于每个工作流程，同时考虑到特定目标的要求。 为获得最佳结果，请选择所需的 ChIP 试剂盒，然后选择相应的 Chromatin EasyShear 试剂盒（以优化染色质剪切）。染色质 EasyShear 试剂盒可独立于 Diagenode 的 ChIP 试剂盒使用，用于在任何染色质免疫沉淀方案之前制备染色质。根据您的特定实验需求选择合适的试剂盒。 State 电子邮件*电子邮件验证* 评论 联系我State电子邮件 *邮箱验证*评论联系我 /div> /div>电子邮件 *邮箱验证*注释 联系我State电子邮件 *邮箱验证*Comment联系我每个IP数量 单元格 4,000,000 组织 30 mg 细胞上的 ChIP-seq
![\"ChIP-seq](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-TF-chip-seq-A.png\")
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ChIP-seq on tissue
每个 IP 的数量 单元格 4,000,000 纸巾 30 mg 细胞上的 ChIP-seq
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ChIP-seq on tissue
每个IP数量 单元格 4,000,000 组织 30 mg 细胞上的 ChIP-seq
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ChIP-seq on tissue
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ChIP-seq on cells
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![\"图](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/perfect-match-between-chipseq-data.png\")
![\"图](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/iDeal-kit-C01010053-figure-2.jpg\")
组织上的 ChIP-seq
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可用于识别全基因组的蛋白质-DNA 结合位点。 CUT&RUN 的工作原理是利用蛋白 A 融合的 MNase 的 DNA 切割活性来分离与目标蛋白结合的 DNA。这种靶向消化通过添加钙来控制，MNase 需要钙来发挥其核酸酶活性。 MNase 消化后，释放出短的 DNA 片段，然后可以将其纯化用于后续的文库制备和高通量测序。鉴于酶促应用，CUT&RUN 不需要机械剪切染色质roach，强烈建议对输入 DNA 进行超声处理（用于比较富集样品），以便与下游 NGS 兼容。 Bioruptor Pico 是生成具有紧密分布的最佳 DNA 片段的理想选择仪器，可确保为您的 CUT&RUN 分析提供出色的文库制备和出色的测序结果。 立即探索 Bioruptor Pico .
![\"Bioruptor](\"https://www.diagenode.com/img/product/shearing_technologies/pico-request-demo.jpg\")
\',\'label1\' => \'规格\',\'info1\' => \'\',\'label2\' => \'查看 Bioruptor® Pico 的配件和耗材\',\'info2\' => \'
Shearing Accessories
名称 目录号 吞吐量 0.2 ml 试管的试管架 B01201144 16 个样本0.65 ml 试管的试管架 B01201143 12 个样本 1.5 ml 试管的试管架 6 个样本 15 ml 超声处理配件 B01200016 6 个样本 剪切耗材
名称 目录号 0.2 ml Pico Microtubes C300100200.65 ml Pico Microtubes/ td> C30010011 1.5 ml Pico Microtubes C30010016 15 ml Pico Tubes C30010017 15 ml Pico Tubes & sonication beads C01020031 试剂盒选择指南
样本类型样本输入KITSDS 浓度 核隔离 CELLS < 100,000 染色质 EasyShear 试剂盒高 SDS 1% ![](\"https://www.diagenode.com/img/cross-unvalid-green.jpg\")
单元格 > 100,000 染色质 EasyShear 试剂盒超低 SDS <0.1% ![](\"https://www.diagenode.com/img/valid.png\")
TISSUE 染色质 EasyShear 试剂盒超低 SDS < ; 0.1% 植物组织 Chromatin EasyShear Kitfor Plant 0.5% FFPE 样本 染色质 EasyShear 试剂盒低 SDS 0.2 % ![](\"https://www.diagenode.com/img/label-tf.png\")
单元格 染色质 EasyShear 试剂盒低 SDS 0.2% TISSUE FFPE 样本 使用染色质 EasyShear 试剂盒进行最佳染色质制备的指南 阅读更多
![\"CTCF](\"https://www.diagenode.com/img/)
![\"CTCF](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-figure-b-)
![\"Top40](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/match-of-the-)
![](\"https://www.diagenode.com/img/buttons)
![\"ChIP-seq](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-TF-chip-seq-A.)
![\"p300](\"https://www.diagenode.com/img/product/antibodies/C15200211-)
![\"Figure](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/iDeal-kit-C01010053)
![\"图](\"https://www.diagenode.com/img/product/kits/ideal-figure-h3k4me3)
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